Equipo Aqua

En el mundo Pokémon, el Equipo Aqua es un grupo de ladrones/pacificadores en la región Hoenn. Se especializan en Pokémon de agua y siniestros. La base del Equipo Aqua es un submarino nuclear gigante fuera del mar, con un helicóptero para viajar por mar y tierra. Los miembros del equipo usan camisas blancas con rayas horizontales negras y jeans. Su pañoleta tiene una letra "A" dibujada con forma de huesos (como los de las banderas piratas). Como el Equipo Magma, el Equipo Aqua es dirigido por una ruda Comandante. Shelly es referida como la Líder del Equipo Aqua, aunque el actual líder es Archie (Aogiri en la versión japonesa).

El Equipo Aqua es comparado con una banda de piratas y son expertos en el campo de la Oceanografía al igual que de los Pokémon de agua. Ellos sólo existen en la región Hoenn y no reconocen al Equipo Rocket, a diferencia del Equipo Magma. El Equipo Aqua son los antagonistas principales del Equipo Magma y están actualmente en una guerra con los otros. La principal meta del Equipo Aqua es inundar [parcialmente] el mundo como un gigante océano para sus Pokémon de agua, creyendo que haciendo esto harán del mundo un lugar mejor. Para ese fin, despertarán a Kyogre de su sueño.

El Equipo Aqua es ligeramente menos violento que el Equipo Magma (y viceversa en el manga), y tiene más mujeres en su grupo. La Comandante del Equipo Aqua es una mujer, y sus principales pensamientos sobre Ash Ketchump no son muy claros, aunque ella y el Comandante del Equipo Magma lo ven como un estorbo. El Equipo Aqua es bien conocido en la región Hoenn, y a menudo chantajean a los pescadores locales para decir mentiras.